1. Сначала о цитате. Выражение "Вычисления показывают..." - псевдонаучный бред. Либо должны быть приведены "вычисления", либо дана ссылка на такие вычисления. Их скорее всего нет. Набор подобных фраз - характерная черта подобных рассуждений революционистов (или креационистов) от науки (псевдонауки). 2. Приведенная фраза показывает непонимание автора термина "диффузия", поскольку в первой половине фразы речь идет об ионе, во второй об атоме - совершенно разных состояниях вещества.
3. Диффузии ионов - составных частей химически связанных веществ - мешают химические связи (школьный курс химии, кристаллохимия). Диффузии атомов через кристаллическую решетку мешает, в основном, соотношение размеров атома-мигранта и ячеек решетки, но не запрещает ее.
4. Окаменелости состоят из кристаллического вещества, что и обуславливает их устойчивость, ввиду отсутствия диффузии. Через окаменелости диффузия, в принципе, возможна, но она не влияет на саму форму (вода проходит через губку, но форму губки не меняет). В процессе диффузии возможно замещение вешества окаменелости диффундирующим веществом (если оно, по каким-либо причинам, имеет более высокую химическую активность), но опять же не приводит к измененю формы, возникают псевдоморфозы.